More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2596 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
159 aa  329  8e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
168 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
154 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  40.37 
 
 
156 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  40.76 
 
 
322 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  50.42 
 
 
228 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
148 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
173 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  35.44 
 
 
151 aa  100  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
148 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
157 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
163 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 
162 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 
151 aa  89  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.38 
 
 
383 aa  87.8  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.9 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.9 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.9 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  35.26 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.38 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.59 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.97 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.62 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  33.75 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  30.61 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  29.14 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  24.38 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.66 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.35 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  29.3 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  29.14 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  27.22 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  29.11 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  29.14 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  29.25 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  30.51 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  27.71 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  27.85 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  32.47 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  29.71 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  27.81 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  27.81 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  27.1 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  25.52 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.35 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  25.46 
 
 
263 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  30.34 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.75 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  29.11 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.75 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  39.42 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  30.09 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  28.3 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  29.49 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  35.51 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3078  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  27.52 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  29.58 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  28.78 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  27.56 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  27.56 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  30.17 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  27.56 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  27.56 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  29.87 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>