229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0211 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  33.16 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  34.74 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  38.33 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  30.14 
 
 
263 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  29.47 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  34.2 
 
 
267 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  32.46 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  30.39 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  25 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.32 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  25.52 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.2 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  29.84 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  23.04 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.32 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  31.78 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  27.75 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  39.67 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  26.32 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  32.38 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.32 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  36.7 
 
 
144 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.32 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  26.18 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
148 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  30.97 
 
 
322 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  32.64 
 
 
670 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  26.04 
 
 
153 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
148 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  38.18 
 
 
148 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 
228 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.17 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  25.93 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
148 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  25.77 
 
 
156 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.88 
 
 
383 aa  58.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
157 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  28.49 
 
 
183 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.32 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.67 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  35.21 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  29.12 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.61 
 
 
146 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.61 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
144 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  24.35 
 
 
168 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  25.93 
 
 
163 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  36.61 
 
 
144 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.61 
 
 
146 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.61 
 
 
144 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  30.22 
 
 
167 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  22.56 
 
 
183 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  30.7 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  26.7 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.52 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  29.6 
 
 
146 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.52 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 
150 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.11 
 
 
149 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
154 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.26 
 
 
148 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.32 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  25.76 
 
 
151 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  33.91 
 
 
150 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 
158 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  33.02 
 
 
150 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 
145 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  33.91 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  32.73 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  32.11 
 
 
162 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  27.06 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  29.47 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.36 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  33.03 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.29 
 
 
154 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  34.82 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  26.9 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  34.91 
 
 
159 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  30.47 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  34.82 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  30.82 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 
158 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  27.61 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>