298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4022 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  88.24 
 
 
204 aa  353  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  51.23 
 
 
192 aa  197  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
263 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  39.89 
 
 
267 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
214 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  34.16 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.93 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.38 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  38.05 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  34.01 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  36.21 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  30.54 
 
 
670 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  39.29 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  28.86 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 
156 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  31.05 
 
 
167 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
167 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  39.67 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
154 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.06 
 
 
151 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.32 
 
 
154 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  31.39 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  36.44 
 
 
158 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.21 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  30.52 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 
152 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  35.64 
 
 
175 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 
154 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.21 
 
 
151 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  37.63 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  27.21 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  39.64 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 
166 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
154 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  34.55 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.74 
 
 
160 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
154 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.13 
 
 
154 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  29.46 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  34.65 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  37.89 
 
 
159 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  29.33 
 
 
175 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  26.5 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
147 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  35.35 
 
 
164 aa  55.5  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  28.92 
 
 
172 aa  55.1  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
155 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.98 
 
 
154 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  31.67 
 
 
146 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
159 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
166 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  31.71 
 
 
148 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.43 
 
 
157 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  34.17 
 
 
155 aa  54.7  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  34.02 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  34.15 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  38.54 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34.65 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  29.77 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  26.9 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  32.98 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  32.98 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  31.44 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
159 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.98 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  26.83 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  26.83 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  27.94 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  37.63 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.98 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.98 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  36.27 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>