287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24620 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  41.81 
 
 
670 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  38.8 
 
 
214 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  38.04 
 
 
207 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  36.46 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  45.37 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.04 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  32.45 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 
146 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  37.7 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  31.84 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  44.86 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  34.91 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  42.71 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.68 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  31.36 
 
 
144 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  32.71 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  34.21 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  41.12 
 
 
148 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  39.45 
 
 
159 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  41.12 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  40.19 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  39.45 
 
 
144 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  32.73 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.62 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  35.85 
 
 
144 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  28.82 
 
 
144 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.62 
 
 
146 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  39.62 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35.24 
 
 
145 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.62 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.62 
 
 
146 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  42.39 
 
 
145 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.55 
 
 
150 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 
146 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.78 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 
157 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  28.93 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.76 
 
 
155 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.65 
 
 
146 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
124 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.66 
 
 
146 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  32.38 
 
 
143 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  38.46 
 
 
149 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 
147 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
145 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
147 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.86 
 
 
383 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  31.13 
 
 
148 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  29.09 
 
 
322 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  36.27 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.04 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
147 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>