298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3640 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  88.24 
 
 		 204 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 263 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  40.1 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  36.87 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  36.95 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  38.2 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  36.04 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  26 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.2 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  37.07 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  35.82 
 
 		 149 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  32.63 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  38.05 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  30.81 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.91 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  30.85 
 
 		 670 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.06 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  25.89 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  39.37 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  36.52 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  37.17 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.06 
 
 		 151 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  40.82 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  30.39 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.78 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  36.07 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  31.68 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  36.51 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.53 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  31.87 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  28.86 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.36 
 
 		 453 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  35.64 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  42.16 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.42 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  31.13 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  36.21 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  32.5 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  36.29 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.09 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  33.04 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  38.3 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  30.51 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  35.35 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  36.56 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  33.94 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.84 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  36.45 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  34.43 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  34.55 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  27.61 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  28.92 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  31.4 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  33.88 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  33.88 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.41 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  40.86 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>