More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0675 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 149 aa  306  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  53.52 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  46.75 
 
 		 166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  45.75 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 		 161 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.72 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  41.78 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  46.81 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 		 158 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.62 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.72 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.59 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.33 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  46.81 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  43.84 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.13 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.92 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  40.97 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.17 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.79 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  38.31 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  39.73 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.87 
 
 		 154 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.89 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.22 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.74 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  39.74 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  39.22 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.61 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.74 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.74 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.74 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.74 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  39.07 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  41.14 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.76 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  36.81 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.75 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  46.71 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  46.71 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  47.66 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 		 201 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  46.46 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  41.26 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>