More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1706 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 163 aa  339  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  67.32 
 
 		 157 aa  219  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  55.92 
 
 		 155 aa  190  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  57.53 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  57.24 
 
 		 155 aa  187  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  56.85 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  58.28 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  54 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  55.19 
 
 		 158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  54.36 
 
 		 160 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  56.96 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  53.02 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  53.69 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  54.84 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  52.98 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  51.55 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  53.55 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  53.29 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  49.37 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  54.61 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  50.98 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.86 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  48.73 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  48.73 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  48.73 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  48.72 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  51.3 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  50.66 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  50.99 
 
 		 182 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.4 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  49.34 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.32 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  47.74 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.41 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  46.31 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  45.64 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  46.75 
 
 		 163 aa  140  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  46.71 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  46.98 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  42.35 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.22 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 		 188 aa  133  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.23 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  44.97 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  43.67 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.4 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.76 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.51 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2038  protein tyrosine phosphatase  44.78 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 157 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.62 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>