More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0240 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 154 aa  327  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.91 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  38.16 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.16 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  37.5 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.97 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  40.27 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  37.09 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.35 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  43.65 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  39.68 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.9 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.06 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  41.27 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.41 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  38.4 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.68 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  36.51 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  38.4 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.6 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  37.88 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  36.96 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  37.25 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1641  phosphotyrosine protein phosphatase  39.37 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0391  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  37.01 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.6 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  38.58 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  35.53 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.29 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.76 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.29 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.76 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.76 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.76 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.76 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  32.53 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>