More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1419 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 
154 aa  323  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  86.27 
 
 
154 aa  282  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  86.27 
 
 
154 aa  282  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
162 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.87 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  43.87 
 
 
154 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
154 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.97 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.97 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  44.97 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.97 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.97 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.97 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  41.89 
 
 
158 aa  133  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.23 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
162 aa  116  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
162 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.38 
 
 
453 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  39.19 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.66 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 
145 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
155 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
145 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
150 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 
152 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
155 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  38.1 
 
 
157 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
160 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
154 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
154 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  36.51 
 
 
172 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 
158 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
154 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
154 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 
164 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  36.08 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.77 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.77 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.11 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  37.16 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
182 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  32.3 
 
 
174 aa  96.7  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  32.45 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.41 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  34.69 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  34.25 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  32.45 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  31.54 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  39.07 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.87 
 
 
154 aa  94.4  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
167 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 
149 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
173 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  34.55 
 
 
172 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  32.45 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.87 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 
154 aa  92  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  32.21 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  29.63 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  37.09 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 
160 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.17 
 
 
151 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  34.69 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.05 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 
163 aa  90.5  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
171 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 
166 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  34.9 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 
160 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>