More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0949 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 
164 aa  340  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  94.51 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  67.47 
 
 
166 aa  230  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  45.28 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 
162 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 
154 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 
154 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  45.28 
 
 
160 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 
154 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.81 
 
 
160 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 
154 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 
163 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  47.65 
 
 
154 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  43.37 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 
154 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  44.24 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  47.97 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  44.81 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.15 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  42.76 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.51 
 
 
159 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 
182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 
162 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 
160 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  43.23 
 
 
157 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 
165 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
157 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 
165 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 
159 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
161 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
162 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 
158 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
154 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.53 
 
 
159 aa  121  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
162 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  41.83 
 
 
155 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 
163 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  42.18 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.18 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  39.24 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.59 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  40.52 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 
149 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.33 
 
 
155 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  39.43 
 
 
196 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
166 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.51 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  40.25 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 
165 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  45.58 
 
 
154 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  38.04 
 
 
188 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 
171 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  43.48 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  39.87 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  38.99 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.36 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  43.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  43.06 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  42.41 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
160 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
159 aa  111  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  39.61 
 
 
157 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.65 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.61 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  39.62 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>