More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2509 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
162 aa  332  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  61.01 
 
 
160 aa  204  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  61.44 
 
 
158 aa  191  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  60.13 
 
 
167 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  60.26 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  58.23 
 
 
160 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  57.59 
 
 
160 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  60.78 
 
 
171 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  59.87 
 
 
155 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.67 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  58.82 
 
 
171 aa  180  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  59.46 
 
 
160 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  51.28 
 
 
155 aa  177  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  52.2 
 
 
157 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  54.72 
 
 
154 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 
163 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  59.06 
 
 
147 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  52.6 
 
 
149 aa  173  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  170  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  51.28 
 
 
155 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 
161 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  49.04 
 
 
161 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
154 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  46.54 
 
 
166 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  47.13 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
163 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
165 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  47.13 
 
 
165 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
162 aa  140  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  48.73 
 
 
154 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  47.47 
 
 
154 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 
154 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 
154 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
160 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
160 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
160 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.51 
 
 
160 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  45.16 
 
 
160 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
159 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 
166 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  46.2 
 
 
154 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  46.84 
 
 
154 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.68 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  41.88 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 
163 aa  127  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
165 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
158 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.68 
 
 
151 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.88 
 
 
159 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.48 
 
 
159 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  42.45 
 
 
157 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 
165 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 
162 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
157 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.14 
 
 
164 aa  120  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
164 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 
157 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.03 
 
 
157 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  38.95 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
157 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  44.08 
 
 
166 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.04 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  45.16 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  46.27 
 
 
161 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
156 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.74 
 
 
154 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 
161 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  44.1 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  44.72 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>