More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4997 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 157 aa  309  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  88.82 
 
 		 159 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  87.01 
 
 		 159 aa  265  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  76.16 
 
 		 155 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  67.11 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  64.05 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  68.63 
 
 		 157 aa  194  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  73.57 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  66.03 
 
 		 157 aa  190  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  65.38 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  61.59 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  67.59 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  57.25 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.63 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  53.19 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  53.19 
 
 		 160 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  53.19 
 
 		 160 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  51.35 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  54.61 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  51.72 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  49.33 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  40.52 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  48.98 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  43.54 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  46.75 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  47.55 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  44.22 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  50.75 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  48.34 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 154 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  47.02 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  47.02 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 		 163 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  42.18 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.18 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  44.52 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.76 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  40.54 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  43.84 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.76 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.76 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  42.76 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  42.76 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.76 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.76 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.76 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  37.34 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.52 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  47.79 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 		 162 aa  116  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.07 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>