More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01330  protein-tyrosine-phosphatase  53.16 
 
 
158 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 
160 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  45.51 
 
 
154 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  46 
 
 
160 aa  120  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
159 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  45.1 
 
 
171 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 
160 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.37 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
163 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.62 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  40.67 
 
 
157 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  42.76 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 
161 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  39.51 
 
 
164 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
166 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  41.03 
 
 
154 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  41.45 
 
 
155 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.82 
 
 
154 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
162 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  43.31 
 
 
166 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
165 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 
160 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.82 
 
 
154 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  38.82 
 
 
154 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.82 
 
 
154 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.82 
 
 
154 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.82 
 
 
154 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.82 
 
 
154 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 
155 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
158 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 
165 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
162 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 
163 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
159 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 
154 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 
171 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.67 
 
 
154 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
156 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
172 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
158 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 
163 aa  101  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.96 
 
 
160 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.41 
 
 
154 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.47 
 
 
155 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 
161 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
141 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
167 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  38.67 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 
158 aa  97.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
154 aa  97.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
171 aa  97.1  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
186 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  40.36 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.41 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  44.22 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
162 aa  94  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  29.63 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  37.33 
 
 
155 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.18 
 
 
151 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
155 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
150 aa  92  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44 
 
 
453 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>