More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2932 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
152 aa  309  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  70 
 
 
158 aa  213  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  58.78 
 
 
171 aa  168  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.97 
 
 
453 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  53.95 
 
 
159 aa  156  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  59.18 
 
 
166 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  48.55 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
186 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 
173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  53.42 
 
 
160 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  46.53 
 
 
157 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 
149 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 
174 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 
160 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 
160 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  53.33 
 
 
166 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  55.48 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  50.98 
 
 
164 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  49.03 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  49.68 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 
165 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 
165 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 
165 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  46.41 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  46.31 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  52.98 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
159 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.37 
 
 
159 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  49.03 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  44.97 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  44.83 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  44.22 
 
 
173 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
166 aa  123  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  46.85 
 
 
155 aa  123  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  48.34 
 
 
157 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  45.66 
 
 
182 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.03 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  46.94 
 
 
162 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 
160 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
160 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 
163 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 
165 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
167 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  43.54 
 
 
155 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  44.83 
 
 
160 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
161 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  48.98 
 
 
165 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  46.26 
 
 
171 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
150 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
171 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 
165 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.41 
 
 
160 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.3 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
159 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.53 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 
164 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  41.5 
 
 
201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  42.36 
 
 
201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.39 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  43.33 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
163 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  48.63 
 
 
154 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
152 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  51.16 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
162 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 
141 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  46.41 
 
 
162 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
161 aa  113  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  45.99 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  44.9 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>