More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0163 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
145 aa  302  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  54.74 
 
 
141 aa  164  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 
174 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 
154 aa  130  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 
155 aa  129  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  48.23 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
150 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
160 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.05 
 
 
453 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
160 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 
162 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 
154 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  45.53 
 
 
152 aa  116  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  47.44 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  43.71 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
165 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 
154 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
158 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  39.24 
 
 
165 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  41.22 
 
 
149 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  43.42 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
159 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.11 
 
 
160 aa  106  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 
173 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  39.35 
 
 
171 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 
162 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  42.76 
 
 
154 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
175 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
161 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  41.89 
 
 
157 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 
161 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  44.8 
 
 
159 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  44.09 
 
 
172 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  47.24 
 
 
166 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
164 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
175 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  44.35 
 
 
158 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
162 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 
163 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
156 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.91 
 
 
164 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.67 
 
 
154 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
155 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
161 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 
166 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
164 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
164 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
164 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
164 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
164 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 
157 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 
150 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.08 
 
 
154 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
162 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.2 
 
 
159 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 
164 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
159 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 
160 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  41.56 
 
 
166 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 
163 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  46.03 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.45 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  35.57 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  35.57 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  42.52 
 
 
201 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 
156 aa  95.9  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.57 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>