More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0078 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
178 aa  355  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  63.95 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  62.43 
 
 
188 aa  194  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  54.76 
 
 
175 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  58.28 
 
 
164 aa  168  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  60.92 
 
 
187 aa  167  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.41 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  47.34 
 
 
172 aa  140  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  48.81 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  47.59 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  44.72 
 
 
166 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  46.43 
 
 
163 aa  121  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  43.6 
 
 
186 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.42 
 
 
453 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  44.58 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  43.03 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  43.03 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  40.83 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  43.03 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  40.36 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  40.96 
 
 
164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  43.02 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  42.17 
 
 
163 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 
182 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 
152 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  42.01 
 
 
183 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.46 
 
 
157 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
155 aa  104  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  39.75 
 
 
161 aa  98.2  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 
159 aa  97.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  34.91 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  37.95 
 
 
160 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
156 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  37.95 
 
 
154 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
154 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
154 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  36.02 
 
 
165 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  34.32 
 
 
175 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 
154 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  37.72 
 
 
162 aa  90.9  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  39.41 
 
 
157 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  32.94 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  37.27 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 
162 aa  88.6  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  39.18 
 
 
155 aa  88.6  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  31.74 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 
160 aa  87.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  36.14 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  38.79 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.91 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  37.34 
 
 
165 aa  85.5  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  35.15 
 
 
157 aa  85.1  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  35.8 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  32.52 
 
 
151 aa  84.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  35.15 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.65 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  36.65 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.12 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  32.94 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  31.68 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.14 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  37.72 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  37.13 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.75 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  32.92 
 
 
160 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01330  protein-tyrosine-phosphatase  39.63 
 
 
158 aa  79  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  34.39 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  32.3 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  31.68 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  32.3 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  30.36 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  30.54 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  32.93 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.57 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>