More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0115 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  54.49 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  58.28 
 
 
178 aa  168  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  56.74 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  52.91 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
175 aa  156  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  47.47 
 
 
163 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 
164 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.85 
 
 
184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  50.98 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 
152 aa  127  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  41.14 
 
 
164 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  39.77 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  45.16 
 
 
155 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  43.56 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 
161 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  44.65 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.5 
 
 
157 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  45.16 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  43.35 
 
 
196 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  40.96 
 
 
186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.88 
 
 
453 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  40.59 
 
 
183 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  44.05 
 
 
182 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
160 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
155 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  40.12 
 
 
175 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  38.92 
 
 
166 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 
160 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
160 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  42.18 
 
 
162 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
160 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 
175 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  39.24 
 
 
154 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  37.13 
 
 
154 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 
182 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
160 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
165 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  36.71 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
174 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.19 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  34.19 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.19 
 
 
154 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.19 
 
 
154 aa  99  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.19 
 
 
154 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  34.19 
 
 
154 aa  99  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  33.95 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.19 
 
 
154 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.19 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
154 aa  97.8  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  41.51 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
163 aa  97.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
163 aa  97.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  37.2 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  37.11 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  37.34 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.55 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  35.88 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  41.36 
 
 
154 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 
162 aa  94.4  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  41.36 
 
 
154 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  35.1 
 
 
151 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  40.12 
 
 
154 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  40.69 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.19 
 
 
160 aa  90.5  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.94 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  30.97 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.18 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.91 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.91 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
164 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.91 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.91 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.91 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>