More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0875 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  56.13 
 
 		 166 aa  166  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  53.95 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  52.7 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  52.98 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  48.68 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.71 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  47.62 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  50.69 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  43.6 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.06 
 
 		 453 aa  114  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  43.27 
 
 		 188 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  32.9 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  42.44 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  47.97 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  38.56 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  37.18 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  40.41 
 
 		 165 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.01 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.01 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  37.01 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  37.01 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.01 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.01 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.01 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  37.34 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  38.93 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.01 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.16 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  39.35 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.36 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.52 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 157 aa  94  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  34 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.49 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.6 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.82 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  37.42 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.58 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  32.9 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.85 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>