More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3348 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  53.25 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  51.2 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  50.6 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  54.74 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.06 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  47.8 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  50.97 
 
 		 160 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  49.68 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  45.75 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  47.74 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  48.63 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  48.61 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.32 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  46.98 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.97 
 
 		 453 aa  137  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  47.4 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  47.4 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  44.79 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  48.68 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  47.48 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.51 
 
 		 157 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.74 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.41 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  43.95 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.45 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  47.8 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  41.36 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.23 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  46.9 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  43.33 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  42.59 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  47.92 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  40.25 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  42.17 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 		 164 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.97 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.45 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  42.48 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  41.4 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 		 157 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  42.66 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>