More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0166 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  64.05 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.1 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  63.09 
 
 
159 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  64.67 
 
 
155 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  62.18 
 
 
157 aa  190  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  60 
 
 
157 aa  171  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  61.7 
 
 
156 aa  166  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  61.07 
 
 
157 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  61.07 
 
 
157 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  59.44 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  54.25 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  54.41 
 
 
161 aa  147  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
160 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  44.23 
 
 
160 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.62 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  49.28 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  44.9 
 
 
162 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
162 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  44.76 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  44.22 
 
 
161 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
166 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  47.26 
 
 
163 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 
154 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 
162 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  40.94 
 
 
157 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
174 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.95 
 
 
151 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.15 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 
155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  40.82 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  40.82 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
166 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
165 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  45.64 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 
158 aa  117  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
162 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  37.66 
 
 
156 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.82 
 
 
154 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 
149 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 
150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  43.38 
 
 
154 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
159 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  38.16 
 
 
157 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 
155 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
159 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
188 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 
164 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  41.14 
 
 
159 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  39.73 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 
166 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
175 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 
175 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.22 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.5 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  40.85 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.74 
 
 
453 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  40.31 
 
 
158 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  40.43 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.14 
 
 
164 aa  108  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.27 
 
 
160 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 
160 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 
171 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
173 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  41.96 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.57 
 
 
161 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>