More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0034 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 182 aa  362  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  63.95 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  60.23 
 
 		 188 aa  191  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  54.49 
 
 		 164 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  53.18 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  52.75 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.3 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  47.25 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  42.08 
 
 		 173 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  43.35 
 
 		 158 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  42.37 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  45.66 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  47.75 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  43.89 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  40.11 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  40.66 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  43.6 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  41.9 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.01 
 
 		 453 aa  111  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  41.04 
 
 		 166 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  39.66 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  40.8 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  39.66 
 
 		 154 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  39.66 
 
 		 154 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 161 aa  94.7  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  37.99 
 
 		 196 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  37.43 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  36.9 
 
 		 163 aa  87.8  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  34.86 
 
 		 165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  30.73 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.21 
 
 		 154 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  31.18 
 
 		 151 aa  84.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  35.33 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  34.57 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  34.66 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  32.57 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  33.14 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  32.42 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  32.2 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  34.3 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  32.76 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  32.76 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  31.4 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  32.18 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  32.76 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  34.66 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.26 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  33.92 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  31.98 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  34.48 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  29.94 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.99 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  24.56 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  31.61 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  31.18 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  31.14 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  28.9 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  31.98 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  32.78 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  32.57 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  32.54 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  33.15 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_002950  PG1641  phosphotyrosine protein phosphatase  33.14 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  31.79 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  30.41 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  32.75 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  33.91 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  31.07 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  27.47 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  31.32 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  30.14 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>