More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  56.07 
 
 		 175 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  62.43 
 
 		 178 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  60.23 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  58.76 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  52.91 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.93 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  41.76 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  43.96 
 
 		 166 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  41.52 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  41.86 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  43.27 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  42.02 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.2 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  43.6 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  41.52 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  41.52 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  41.28 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  42.69 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  39.77 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.08 
 
 		 453 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 		 152 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  41.07 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  40.35 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  40.35 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  40.35 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  38.01 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  42.26 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  40.24 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  43.96 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  36.78 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  39.41 
 
 		 160 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  38.01 
 
 		 154 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  38.01 
 
 		 154 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  38.15 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  38.95 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 		 154 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  38.01 
 
 		 154 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  39.53 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  37.57 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  39.66 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  40.7 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  36.78 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  32.94 
 
 		 162 aa  88.2  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  37.79 
 
 		 154 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  37.79 
 
 		 154 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  37.13 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  37.2 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.55 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.91 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  35.23 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 162 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 		 150 aa  85.5  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  34.94 
 
 		 158 aa  84.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  31.52 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  32.74 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.58 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  30.81 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  32.94 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  33.53 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  33.14 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  34.86 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  33.71 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  28.92 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.14 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  35.12 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  34.36 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.9 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  34 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  29.27 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.14 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.52 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  28.9 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  28.9 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  29.07 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.9 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.9 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.9 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>