More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3847 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  68.93 
 
 
183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  45.66 
 
 
175 aa  148  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  47.75 
 
 
182 aa  141  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  47.9 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 
187 aa  134  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  46.25 
 
 
171 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  44.05 
 
 
164 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 
152 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  41.99 
 
 
178 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  39.88 
 
 
158 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  42.69 
 
 
175 aa  117  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  43.96 
 
 
188 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  41.57 
 
 
166 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  41.42 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.14 
 
 
157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  44.65 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 
160 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
186 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  40.34 
 
 
164 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.04 
 
 
184 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  40.34 
 
 
164 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 
182 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  34.34 
 
 
161 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
165 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
165 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
165 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  37.93 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  41.03 
 
 
152 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.31 
 
 
453 aa  97.8  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  34.57 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  38.04 
 
 
155 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  32.73 
 
 
157 aa  92  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  33.71 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
157 aa  90.9  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 
154 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  34.83 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  35.54 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 
174 aa  89  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  30.95 
 
 
166 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 
163 aa  87.8  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  34.57 
 
 
162 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  34.13 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  34.13 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  29.3 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  30.67 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
154 aa  84.3  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 
175 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.58 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  36.13 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.94 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  31.07 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  34.16 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  32.93 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  32.69 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  34.36 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  28.83 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.88 
 
 
159 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  34.69 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.52 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  35.98 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.25 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  29.19 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  29.94 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.29 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  31.68 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  32.93 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  25.47 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>