More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0406 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  67.86 
 
 		 172 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  48.3 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  47.93 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  49.41 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  50.32 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  44.85 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  40.37 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  35.98 
 
 		 160 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  37.72 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  35.15 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  35.8 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  35.8 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  35.15 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 		 158 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  37.13 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.8 
 
 		 157 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  34.15 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  37.13 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  36.65 
 
 		 155 aa  95.5  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  38.04 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.22 
 
 		 453 aa  94  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  35.8 
 
 		 164 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  34.76 
 
 		 154 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  32.77 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  36.02 
 
 		 159 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 152 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.34 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 154 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  32.21 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  33.74 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  33.74 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  38.04 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.39 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  32.93 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  32.72 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  28.85 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  31.9 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  30.36 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.23 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  27.67 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  29.68 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  34.07 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  25.93 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  25.77 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  32.91 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  29.45 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  30.43 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  29.24 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.12 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  30.52 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  26.19 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  27.67 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  30.91 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  31.01 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  27.98 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2038  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  29.17 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  26.35 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  27.71 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  27.11 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>