More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1791 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
172 aa  358  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  67.86 
 
 
184 aa  238  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  47.25 
 
 
182 aa  147  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
187 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  47.34 
 
 
178 aa  140  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  41.76 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  38.6 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  39.77 
 
 
164 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  40.12 
 
 
175 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.95 
 
 
453 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  36.14 
 
 
158 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  35.71 
 
 
166 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  39.64 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  37.95 
 
 
173 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
152 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  37.65 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  31.52 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  38.6 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  34.76 
 
 
171 aa  94.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.72 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  34.76 
 
 
154 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 
152 aa  91.3  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.59 
 
 
157 aa  90.9  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  32.53 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 
155 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  33.74 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  36.59 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  29.81 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  32.08 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  29.81 
 
 
160 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  29.81 
 
 
160 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  32.73 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  29.81 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  35.98 
 
 
164 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  29.81 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  31.06 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 
174 aa  84.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
149 aa  84.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  29.76 
 
 
165 aa  84  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  28.66 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  29.76 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  31.21 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  27.81 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  32.32 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  32.85 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  30.27 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  25.61 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  28.74 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  29.81 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.93 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.86 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.86 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  28.66 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  27.95 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.3 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  28.75 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  27.75 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  27.88 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  25.44 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  32.1 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  27.98 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  32.08 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  26.95 
 
 
166 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  29.45 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  26.51 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  30.82 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  29.61 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  28.92 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>