More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  45.88 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  47.4 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  48.1 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  42.37 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  39.31 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 		 159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  42.48 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  44.77 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  44.65 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  45.62 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  40.67 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  41.86 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  40.12 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.37 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.19 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  38.16 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  39.61 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 		 157 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  34.39 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  36.71 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.15 
 
 		 453 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.27 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  37.25 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  35.85 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  38.22 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  33.55 
 
 		 151 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  39.52 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  37.42 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  32.72 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  39.61 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 155 aa  94.4  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  29.49 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  35.95 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  33.99 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 		 150 aa  91.3  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 		 165 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  38.56 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.82 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.71 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  32.91 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>