More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1930 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
165 aa  327  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  43.67 
 
 
157 aa  94.4  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 
154 aa  94  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
156 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
148 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  39.6 
 
 
144 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.51 
 
 
146 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.51 
 
 
146 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  33.96 
 
 
322 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.26 
 
 
144 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  38.26 
 
 
144 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.84 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 
147 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.49 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  38.16 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 
146 aa  84.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.01 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.01 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.58 
 
 
148 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 
146 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.01 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  30.2 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  30.18 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2875  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.99 
 
 
287 aa  80.9  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.562148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.93 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  45.79 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.67 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  29.73 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  44.63 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  34.59 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.21 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  44.63 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.39 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.36 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  31.21 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.2 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  30.2 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  33.13 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.2 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.2 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.2 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.2 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  31.61 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
147 aa  72  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353108 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  30.41 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  34.55 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  36.29 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.57 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  32.7 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.06 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>