254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  42.08 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  41.52 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  40.83 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  36.52 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  37.95 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.13 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  39.52 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  36.14 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  34.55 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  33.14 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  31.14 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  33.73 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.73 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  32.92 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  37.34 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  33.95 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.34 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  32.3 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  32.52 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  30.72 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  33.14 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  32.93 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  29.01 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.82 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1641  phosphotyrosine protein phosphatase  28.57 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  29.38 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  28.74 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.4 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  28.4 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  30.91 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  33.73 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  30.86 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.48 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  27.95 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  30.63 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  28.38 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  28.12 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  29.38 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10570  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01880)  27.17 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  28.66 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  28.74 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  29.52 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  28.74 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  27.17 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.4 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  28.74 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.35 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  29.7 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  30.41 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  26.44 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.93 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  29.19 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  29.63 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.44 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0407  protein tyrosine phosphatase  28.31 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  28.07 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  26.38 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  28.14 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  28.05 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  26.79 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  27.54 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>