More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2713 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  57.24 
 
 
164 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 
165 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 
165 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 
165 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  56.21 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  56.21 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  52.7 
 
 
152 aa  148  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  47.77 
 
 
166 aa  147  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.35 
 
 
157 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  52.63 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  45.16 
 
 
164 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 
158 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
159 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  43.33 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  41.46 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  43.6 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
160 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  42.48 
 
 
175 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  45.14 
 
 
152 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
178 aa  104  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  45.81 
 
 
167 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
187 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 
161 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
165 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
165 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
186 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.65 
 
 
184 aa  95.5  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
154 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 
174 aa  94  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
164 aa  94  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  42.38 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  38.19 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  39.6 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.65 
 
 
453 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  39.46 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 
165 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.87 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.52 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  33.13 
 
 
172 aa  90.5  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  40.27 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  36.6 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  29.22 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
183 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  30.26 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.76 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.53 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.92 
 
 
154 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  30.92 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  28.67 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.67 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  31.97 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.11 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>