More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3741 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
162 aa  332  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  83.95 
 
 
168 aa  265  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  52.26 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  52.56 
 
 
162 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  47.44 
 
 
156 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 
154 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  46.36 
 
 
154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 
155 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  46.41 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  46.36 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  46.41 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  46.36 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  46.36 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  46.36 
 
 
154 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
154 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  45.75 
 
 
154 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
172 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  43.79 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  40.72 
 
 
174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
161 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 
160 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
162 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
152 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  39.1 
 
 
154 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 
159 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
160 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
160 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
160 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.46 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.46 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.46 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.46 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.46 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 
164 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
158 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
163 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.7 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  38.65 
 
 
172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.36 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  37.42 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 
154 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
158 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
163 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
160 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.14 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.14 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.51 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  44.9 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.81 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  40.76 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
165 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 
172 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  38.56 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  42.86 
 
 
166 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.27 
 
 
160 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.51 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  35.9 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  37.09 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 
154 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 
165 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.56 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  43.71 
 
 
163 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 
163 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 
182 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
159 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.18 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  44.88 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.51 
 
 
453 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 
152 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
159 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
145 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
160 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 
166 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  39.24 
 
 
164 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  39.73 
 
 
175 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 
165 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  44.59 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
171 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.33 
 
 
154 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.87 
 
 
154 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 
155 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
157 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  39.74 
 
 
157 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  32.9 
 
 
157 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>