More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1040 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
155 aa  322  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  54.48 
 
 
166 aa  168  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  47.95 
 
 
158 aa  160  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  42.57 
 
 
151 aa  134  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
162 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.33 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.79 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  40.79 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.79 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.79 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.79 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  40.67 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.13 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1164  protein-tyrosine-phosphatase  41.22 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000978819  hitchhiker  1.39991e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.13 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 
155 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  41.89 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.33 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.67 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.67 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
154 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  39.47 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
158 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  38.85 
 
 
154 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.18 
 
 
186 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 
154 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 
154 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  36.94 
 
 
154 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  34.16 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  32.24 
 
 
175 aa  94.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  30.26 
 
 
173 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  31.97 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  31.08 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 
164 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
164 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  31.78 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  34.46 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  31.76 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.55 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 
178 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  32.45 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  29.33 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  31.98 
 
 
175 aa  84.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 
160 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.26 
 
 
151 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.38 
 
 
453 aa  83.6  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  31.13 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.13 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  30.41 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  31.97 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  32.14 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  31.13 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  28.86 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  30.61 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  30.57 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  29.53 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  32.19 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  30.61 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.41 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  29.8 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  27.85 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  30.41 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>