More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1125 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 
154 aa  314  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  62.25 
 
 
151 aa  190  6e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  62.25 
 
 
151 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  60.93 
 
 
151 aa  187  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  44.3 
 
 
186 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
158 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
162 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  36.84 
 
 
154 aa  120  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.84 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  37.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.67 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.18 
 
 
154 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.99 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
172 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  33.99 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  36.71 
 
 
156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
152 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 
174 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
163 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  37.09 
 
 
145 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
159 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
159 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
162 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  37.91 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
154 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
160 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  36.91 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.03 
 
 
155 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.25 
 
 
453 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  36.18 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  34.87 
 
 
154 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  36.91 
 
 
157 aa  94.4  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 
188 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 
166 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  32.45 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  32.19 
 
 
154 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  30 
 
 
151 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  29.87 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.17 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  31.13 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 
172 aa  90.5  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  31.74 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  27.56 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  33.75 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  28.1 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 
154 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 
154 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  31.13 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  30.77 
 
 
159 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  30.26 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  27.74 
 
 
158 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  35.1 
 
 
145 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  30.72 
 
 
154 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 
158 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.07 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  32.21 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  32.89 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  26.8 
 
 
182 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  28.38 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.85 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.88 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  28.03 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>