More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2141 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  46.12 
 
 		 263 aa  161  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.69 
 
 		 194 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  36.22 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  37.56 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  40.84 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.09 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  38.12 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  40.3 
 
 		 267 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  41.46 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 154 aa  89  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  25.77 
 
 		 154 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  44.55 
 
 		 167 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  37.23 
 
 		 202 aa  85.5  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.64 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  47.17 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  44.72 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  40.34 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  30.63 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  31.16 
 
 		 670 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  40.87 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.08 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  46.08 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  41.07 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  32.76 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  28.21 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.13 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  29.06 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.92 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.62 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.04 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  29.69 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  40.87 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  36.52 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.69 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  36.62 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  42.72 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  40.78 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  46.84 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  29.37 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  41.09 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  37.39 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.14 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.58 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  41.75 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  37.39 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.81 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  38.4 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  39.81 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  33.05 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  33.9 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  35.77 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.81 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  34.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  24.87 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.61 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.29 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  34.92 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  31.2 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  37.39 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  36.44 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>