276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3227 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  70 
 
 
214 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
195 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  37.56 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  38.04 
 
 
202 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  51 
 
 
174 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
188 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 
184 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  37.43 
 
 
167 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 
154 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  33.33 
 
 
267 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  30.96 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.65 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
146 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  33.99 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  32.99 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  41.23 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.32 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  42.72 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  41.82 
 
 
148 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  37.72 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.07 
 
 
148 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  36.97 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  37.04 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  29.91 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.89 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  34.82 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  32.28 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  37.17 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  30.09 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  40.23 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
147 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  39.36 
 
 
147 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 
148 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  40.22 
 
 
148 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.56 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 
146 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  29.84 
 
 
670 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.93 
 
 
145 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.57 
 
 
155 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
147 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  30.63 
 
 
153 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
187 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 
144 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  36.97 
 
 
178 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  36.21 
 
 
150 aa  62  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  28.18 
 
 
154 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 
146 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  37.27 
 
 
146 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.46 
 
 
145 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  39.08 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  35.24 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  38.74 
 
 
163 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  36.47 
 
 
143 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.86 
 
 
383 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.43 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  39.18 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
143 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.43 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.18 
 
 
146 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
146 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>