286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0037 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  41.21 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  36.55 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 154 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  38.27 
 
 		 267 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  37.19 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  31.47 
 
 		 263 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  34.52 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  43.12 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 		 167 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.91 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  36.13 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  24.38 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  32.2 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  36.67 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  32.84 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  45.28 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  39.09 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  40.74 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  25.12 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.19 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  37.17 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  38.32 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 143 aa  72  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.81 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 		 148 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.72 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  38.89 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  39.66 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  31.62 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.29 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.63 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  41.84 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  32.11 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  33.16 
 
 		 670 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  32.4 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.77 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  38.78 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  39.32 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  32.54 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.69 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.51 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  37.29 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.72 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  41.84 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 		 145 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.82 
 
 		 145 aa  62  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>