More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2242 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  100 
 
 
149 aa  309  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  100 
 
 
149 aa  309  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  100 
 
 
149 aa  309  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  99.33 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  99.33 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  83.56 
 
 
147 aa  259  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  80.27 
 
 
147 aa  256  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  65.73 
 
 
144 aa  202  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  65.03 
 
 
144 aa  199  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  63.64 
 
 
144 aa  193  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  56.55 
 
 
145 aa  180  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  55.94 
 
 
144 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  54.79 
 
 
167 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  53.85 
 
 
144 aa  167  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  57.04 
 
 
148 aa  165  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  48.03 
 
 
154 aa  150  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  51.39 
 
 
146 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  52.42 
 
 
124 aa  140  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  47.86 
 
 
149 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.2 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  47.26 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.71 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 
145 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
148 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
144 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.62 
 
 
155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  45.26 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  45.26 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.78 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  45.26 
 
 
148 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.19 
 
 
145 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 
144 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
151 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
145 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 
144 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
147 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  40.97 
 
 
144 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
145 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
150 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
147 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
147 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.58 
 
 
144 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  39.58 
 
 
144 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
145 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.89 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
150 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
147 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  36.55 
 
 
164 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
147 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.86 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
164 aa  87  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  38.73 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.03 
 
 
144 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.03 
 
 
144 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  36.24 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  33.75 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  34.43 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>