More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06666 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  59.59 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  58.9 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  64.52 
 
 		 124 aa  181  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 144 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  54.79 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  54.79 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  54.79 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  56.85 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  54.79 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  54.79 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  55.48 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  53.42 
 
 		 147 aa  171  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.48 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.58 
 
 		 144 aa  151  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  45.22 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.97 
 
 		 148 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  44.06 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  44.97 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.44 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 		 147 aa  127  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  44.83 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.61 
 
 		 155 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 144 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.67 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.41 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 		 149 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  42.18 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  39.31 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 144 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.73 
 
 		 144 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  38.36 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.67 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.67 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.57 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 145 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.14 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  34.46 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 146 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  35.86 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 		 145 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 147 aa  91.3  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 151 aa  84.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  31.58 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.77 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  34.97 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  28.76 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6291  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  31.29 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  27.81 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  30.77 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>