225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001118 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  100 
 
 		 124 aa  258  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  64.52 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  56.45 
 
 		 144 aa  157  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  54.84 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  55.65 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  53.23 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  50.81 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  52.42 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.58 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.19 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  47.5 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  51.3 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.55 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  42.74 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  42.24 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  46.96 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.74 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.07 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  39.17 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  36.29 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  42.61 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  38.33 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.64 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.82 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  35.2 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.97 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.67 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  30.65 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  33.87 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.17 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  29.84 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  42.61 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  34.15 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  30.65 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  31.75 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.75 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.75 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  30.65 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  34.45 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  34.45 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.8 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  28.16 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  28.16 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  32.5 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  30.25 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  31.09 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  35.56 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  30.51 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  32.76 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  32.38 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>