More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4094 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  69.59 
 
 		 149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  51.77 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.14 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  49.65 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  46.81 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  48.23 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  50.37 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  44.06 
 
 		 167 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  49.65 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  38 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  43.84 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  34.03 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  41.94 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.61 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.03 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  37.93 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.49 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.86 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  32.64 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  38.62 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.89 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.36 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.9 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.06 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  34.21 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  31.51 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  31.87 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  30.57 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  37.5 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  30.92 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  37.42 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  36.49 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>