More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1584 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
144 aa  300  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  64.58 
 
 
144 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  65.28 
 
 
144 aa  206  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  61.27 
 
 
145 aa  192  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  57.75 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  58.74 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  56.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  55.94 
 
 
149 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  55.94 
 
 
149 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  55.94 
 
 
149 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  55.24 
 
 
149 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  55.24 
 
 
149 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  56.85 
 
 
167 aa  175  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  53.85 
 
 
144 aa  175  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  52.78 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 
154 aa  152  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  46.81 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  47.26 
 
 
145 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  50.81 
 
 
124 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  48.59 
 
 
143 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  47.89 
 
 
143 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.39 
 
 
149 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  46.48 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  45.89 
 
 
146 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.97 
 
 
150 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
147 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  42.18 
 
 
148 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
147 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
151 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.25 
 
 
145 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.1 
 
 
155 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 
146 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 
144 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
145 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
144 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  45.07 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  31.94 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  36.81 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.81 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.81 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  36.81 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  34.03 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.92 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
168 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  34 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  34.46 
 
 
155 aa  83.6  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  35.92 
 
 
144 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.21 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.87 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.21 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.11 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  32.65 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  35.57 
 
 
322 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
155 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>