More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4085 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 149 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  69.59 
 
 		 149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  52.52 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  51.43 
 
 		 144 aa  141  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  49.65 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.04 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  48.2 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  48.2 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  48.2 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  48.2 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  48.2 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  46.85 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  44.44 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  46.81 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  38.26 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.86 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  43.55 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.73 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  41.84 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  39.72 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.32 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  36.55 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.24 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  44.83 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  34.53 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  47.3 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  32.35 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.86 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  30.2 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  39.5 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.32 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  38.03 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.32 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  36.89 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  30.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  42.72 
 
 		 209 aa  72  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.21 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  31.91 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  35.22 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.21 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  31.51 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  31.33 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  31.87 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  28.86 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>