More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6291 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6291  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  43.54 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  44.9 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 		 166 aa  84.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 		 158 aa  84.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 		 164 aa  84.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  39.39 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  41.43 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  35.42 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.33 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  36.17 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  37.23 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.97 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.4 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  34.56 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  36.96 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  30.94 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  35.11 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  37.88 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.17 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01330  protein-tyrosine-phosphatase  37.41 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.69 
 
 		 186 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 171 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.66 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  34.09 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.23 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  36.42 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  33.8 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  31.21 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.93 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  32.37 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  32.61 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  35.37 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  35.2 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.79 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0440  phosphotyrosine protein phosphatase  34.29 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.300087  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.97 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>