160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1290 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  43.1 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.78 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 		 195 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  33.48 
 
 		 192 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  31.47 
 
 		 209 aa  89.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.65 
 
 		 194 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  36.02 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  32.88 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  32.02 
 
 		 167 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  34.47 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  34.53 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  25.46 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  24.53 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  29.27 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  25.82 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  28.9 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  25.36 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  40.66 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  26.62 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  29.49 
 
 		 670 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  29.84 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  28.47 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.97 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.26 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  29.45 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  23.26 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  28.88 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  26.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  28.5 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  28.36 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  24.46 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  25.9 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  25.24 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  27.96 
 
 		 165 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.68 
 
 		 148 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  27.96 
 
 		 165 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  27.96 
 
 		 165 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 		 164 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  27.43 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  29.17 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  30.95 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  28.03 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  30.23 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  25.74 
 
 		 143 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  24.51 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 165 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 182 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  25.98 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 		 162 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  25.98 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.68 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  30.39 
 
 		 184 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 147 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.46 
 
 		 148 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  32.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  28.69 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.26 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  27.16 
 
 		 150 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  27.59 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  30.15 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  23.4 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.93 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.75 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  27.94 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.43 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>