261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2909 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
184 aa  358  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  49.44 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  37.57 
 
 
214 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  38.76 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  36.46 
 
 
202 aa  84.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  34.52 
 
 
209 aa  80.9  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  37.34 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  39.02 
 
 
670 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.75 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  37.02 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  30.95 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  34.47 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.65 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  37.39 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  30.34 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  23.94 
 
 
322 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  28.09 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  41.76 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  40.38 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  37.19 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  32.74 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.95 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  38.79 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.79 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.25 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  43.56 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.5 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
146 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
146 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  36.67 
 
 
144 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
153 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  40.2 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.93 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 
154 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.04 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
146 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  36.56 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  36.79 
 
 
148 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
149 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
149 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  30.58 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  36.04 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  38.68 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  25.29 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  37.74 
 
 
148 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.62 
 
 
144 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  38.68 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  30.05 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.54 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  27.42 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  31.87 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.04 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  34.58 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>