227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1721 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.63 
 
 
139 aa  143  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  49.63 
 
 
139 aa  143  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
153 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
156 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 
148 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.27 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.69 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  35.86 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.69 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.87 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  33.76 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  33.11 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  28.97 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  34.75 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  32.47 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  29.5 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.14 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  28.06 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  31.75 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.84 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  31.75 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  31.75 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  26.76 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  31.5 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  31.5 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  30.6 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  29.01 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.41 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  27.91 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  28.66 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 
228 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  25.19 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.07 
 
 
383 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  24.48 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 
184 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  29.13 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.89 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.52 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  31.3 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  30.16 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.78 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  30.47 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  30.33 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  29.77 
 
 
167 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  28.91 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 
209 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  28.46 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  31.07 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  26.9 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  27.07 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  28.28 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  23.74 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  25.17 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  30.7 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  29.51 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  28.28 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  23.68 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  28.87 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  24.83 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  27.48 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  27.14 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  28.99 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>