More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2337 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2337  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  31.29 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  34.92 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  30.97 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  28.4 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  31.47 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  26.9 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  33.62 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  30.92 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.29 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  28.97 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1853  protein tyrosine phosphatase  29.66 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  26.79 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  30.61 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  25 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.65 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.65 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  24.65 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  29.05 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 		 695 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.65 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  30.06 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  27.66 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  26.9 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  29.17 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  31.08 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  27.14 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  27.5 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.65 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  26.81 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  23.94 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.33 
 
 		 453 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  30.72 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  29.78 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  29.05 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  23.94 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0391  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  32.21 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  23.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  28.4 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  25.66 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  23.24 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  27.67 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  27.67 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  31.47 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  27.67 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.57 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0407  protein tyrosine phosphatase  27.74 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  27.95 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  33.03 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>