121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2401 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2401  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 279 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3078  protein tyrosine phosphatase  71.48 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2875  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.8 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.562148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4159  protein tyrosine phosphatase  39.79 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00858816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  35.83 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  27.89 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  29.45 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.87 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  25.69 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  30.14 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  25.49 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 		 148 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  35.83 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  26.98 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  28.9 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  26.71 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  34.59 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  33.83 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  26.85 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  28.12 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 173 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  28.08 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  34.45 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  25.95 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  30.6 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  34.45 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  29.09 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  27.4 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 		 164 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  27.4 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  27.4 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  31.97 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.53 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  25.87 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  25.87 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.08 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.71 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  25.6 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  31.4 
 
 		 152 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.71 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 		 147 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  28.08 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  35.29 
 
 		 144 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  29.63 
 
 		 156 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.45 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  31.4 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  30.56 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  28.79 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  27.89 
 
 		 165 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  27.22 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  32.52 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  31.97 
 
 		 144 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.97 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.97 
 
 		 144 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  22.96 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  26.4 
 
 		 154 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  28.81 
 
 		 150 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  29.66 
 
 		 157 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  26.71 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  32.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  27.61 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  26.67 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.21 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  35.83 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  26.23 
 
 		 167 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  29.27 
 
 		 150 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 145 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  29.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  29.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  29.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  30.86 
 
 		 695 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  29.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  24.83 
 
 		 151 aa  45.8  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  28.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  20.95 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  27.87 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>