More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2878 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
112 aa  228  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  47.62 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.27 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  33.68 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.64 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  36.11 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  40.96 
 
 
266 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  32.61 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  32.35 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.49 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
110 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
228 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
116 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.07 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.07 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
121 aa  50.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  37.14 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
111 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  39.39 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.64 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.64 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  37.5 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  33.7 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
215 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  32.86 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  44.78 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  34.72 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>