29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1366 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  35.12 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  33.06 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  29.03 
 
 		 272 aa  138  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0279242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0656  4-vinyl reductase, 4VR  25.71 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  26.5 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  29.41 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 171 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  24.68 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  29.63 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  36.84 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  38.71 
 
 		 391 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 142 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0795  hypothetical protein  36.07 
 
 		 297 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 212 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  38.71 
 
 		 391 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 154 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 142 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>