20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0960 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  32.88 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  34.53 
 
 
267 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
278 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
259 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  25.75 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0656  4-vinyl reductase, 4VR  28.57 
 
 
244 aa  51.6  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0613  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  30.43 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0788482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6403  4-vinyl protochlorophyllide reductase  30 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  26.89 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  25.5 
 
 
181 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  26.25 
 
 
272 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  26.81 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  33.73 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  31.58 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0692  4-vinyl reductase 4VR  40 
 
 
241 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1015  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  26.76 
 
 
206 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0280  bacteriochlorophyll synthase, 23 kDa subunit (bchJ)  26.76 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1923  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  26.76 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>